基因组精细图测序数据分析流程

Published at 2020-05-20 08:51

Author：zhixy

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  1. 测序原始数据质控

    1.1 fastp

  2. 序列拼接

    2.1 velvet

    2.2 SPAdes

  3. 序列拼接后的补洞

    3.1 GapCloser

  4. 组装质量评估

    4.1 QUAST

  5. 测序深度的估算

    5.1 bwa/samtools

  6. 基因组序列注释

    6.1 prokka